미케나 마을에 도착한 지우와 피카츄. 갑자기 등장한 디아루가와 펄기아, 기라티나의 싸움으로 수천 년 전, 인간에게 배신당해 잠들었던 아르세우스가 분노와 함께 깨어난다. 복수를 위해 아르세우스는 미케나 마을을 공격하고, 신전의 수호자 시나는 이를 막아보려 하지만 그의 강대한 분노 앞에 마을은 돌이킬 수 없는 위험에 빠진다. 지우와 피카츄 일행은 미래를 구하기 위해 시공간을 초월한 모험을 떠나고, 그 곳에서 엄청난 비밀을 마주하는데…
출시 됨: Jul 18, 2009
실행 시간: 98 의사록
별: 마츠모토 리카, 오오타니 이쿠에, 우에다 유지, 토요구치 메구미, 코자쿠라 에츠코, 하야시바라 메구미
Crew: 유야마 쿠니히코 (Director), Tomoko Takei (Key Animation), 岩根雅明 (Key Animation), 瀬尾康博 (Key Animation), 津熊健徳 (Key Animation), 佐藤雄三 (Key Animation)